Il Mondo è nel caos più totale dopo la scoperta delle Cellule Oracle, una nuova e misteriosa forma di energia che avrebbe dovuto semplificare la vita agli Umani ma accadde un imprevisto che nessuno tra le più brillanti menti si sarebbe mai aspettato: la comparsa di nuove forme di vita, organismi brutali e astuti che iniziarono a consumare ogni cosa, evolvendosi e adattandosi alle vane strategie umane. Presto, in ogni angolo della Terra cominciarono ad apparire queste strane creature divoratrici, che vennero denominate Aragami (Dei Portatori di Distruzione) e che continuarono la loro opera di massacro, uccidendo e facendo a pezzi chiunque fosse così sfortunato da trovarsi sulla loro strada. Fu l’inizio della fine della razza umana, impotente di fronte a queste bestie fameliche dai poteri quasi divini, destinate a spazzare via ogni traccia di umanità dal Mondo.
Qualche anno dopo i massacri operati dagli Aragami, un’organizzazione di brillanti e coraggiosi Umani si erge a bastione di difesa contro queste terribili creature: la Fenrir, creata con il preciso scopo di debellare per sempre la minaccia, cercando di restituire libertà e speranza a ciò che rimane dell’umanità. Per perseguire i loro nobili obiettivi sono state create delle armi particolari, i God Ark, ovvero Aragami creati in laboratorio da Cellule Oracle controllate che possono contrastare questi mostri, ferendoli e distruggendo i loro corpi divorandone il loro nucleo, unico punto debole di queste subdole creature. Ovviamente, solo alcune persone possono maneggiare e controllare appieno i God Ark per scatenarne la potenza devastante, questi individui sono i God Eater (Divoratori di Dei), Umani a cui viene iniettato una piccola parte delle Cellule Oracle, facendoli diventare esseri con poteri simili a quelli degli Aragami, in grado di poter combattere alla pari contro questi mostri.
Noi vestiremo i panni di un/una giovane God Eater di nuova generazione, in grado di controllare e cambiare forma e dimensione al God Ark, trasformandolo da arma per il combattimento ravvicinato a cannone per colpire gli Aragami a grandi distanze, pianificando strategie diverse a seconda delle situazioni che accadranno durante i vari scontri. Dopo aver superato il test di idoneità per le giovani reclute Fenrir, il/la nostra Divoratrice riceverà il suo God Ark e inizierà a fare la conoscenza con alcuni tra i più esperti God Eater, tra cui Lindow Amamiya, carismatico capitano della Prima Unità, Sakuya Tachibana, una formidabile maestra nel cecchinaggio e Soma, un misterioso spadaccino che lavora sempre in solitario, guadagnandosi il rispetto degli altri God Eater nei massacri di Aragami a dispetto della sua giovane età. Mentre inizia a farsi nuove amicizie e a prendere confidenza con le sue capacità di uccisore di mostri, il/la nostra Divoratrice dovrà prepararsi a scoprire nuove sconvolgenti verità, nascoste sotto la superficie della lotta tra Umani, Aragami e God Eater, per poter far fronte a delle minacce insidiose e subdole come le spire di un serpente, cercando di impedire che la razza umana vada incontro alla sua distruzione più totale.
